技术特征:
1.一种长链非编码核糖核酸自噬影响神经胶质瘤的预后模型的构建方法,其特征在于,包括以下步骤:s1:筛选与lncrna相关的转录基因样本、筛选与自噬相关的lncrna基因、收集胶质瘤患者的临床os数据,并将以上三组数据合并;s2:利用edger软件筛选与自噬相关的lncrna样本中的差异表达基因,并利用r软件对与自噬相关的lncrna差异表达基因进行kegg和go富集分析,从而确定lncrna的功能和通路;s3:利用单变量和多变量cox回归分析确定自噬相关的长链非编码核糖核酸与独立危险因素之间的相关性;s4:根据s1中合并后的数据利用edger软件筛选42个与神经胶质瘤自噬相关的lncrna,并将其与收集的胶质瘤患者的临床os数据进行重叠,构建神经胶质瘤的预后模型,从而得到36个lncrna与胶质瘤的预后相关;s5:利用roc分析评估lncrna的特征,采用校准曲线评估预测的生存时间与实际生存时间是否一致,并利用auc验证预后模型的预测性能和准确性;s6:通过生存分析、风险分析和独立的预后分析验证神经胶质瘤的预后模型。2.根据权利要求1所述的一种长链非编码核糖核酸自噬影响神经胶质瘤的预后模型的构建方法,其特征在于,在步骤s1中,通过收集1114例胶质瘤患者的临床数据,使用生存分析比较高危组和低危组的生存率,计算胶质瘤患者的风险,并确定胶质瘤患者的os,从而得到胶质瘤患者的临床os数据。3.根据权利要求1所述的一种长链非编码核糖核酸自噬影响神经胶质瘤的预后模型的构建方法,其特征在于,在步骤s2中,使用edger软件,通过利用修正的p值和错误发现率识别具有统计学意义的靶基因,纠正假阳性,再去除没有相应基因名称的探针集或具有多个探针集的基因,从而筛选出与自噬相关的lncrna样本中的差异表达基因。4.根据权利权利要求1所述的一种长链非编码核糖核酸自噬影响神经胶质瘤的预后模型的构建方法,其特征在于,对胶质瘤患者的临床特征和风险值进行临床相关性分析。5.根据权利要求1所述的一种长链非编码核糖核酸自噬影响神经胶质瘤的预后模型的构建方法,其特征在于,在36个与预后相关的lncrna中,有22个lncrna基因在胶质瘤细胞中高表达、14个lncrna基因在胶质瘤细胞中低表达。6.根据权利要求1所述的一种长链非编码核糖核酸自噬影响神经胶质瘤的预后模型的构建方法,其特征在于,在lncrna中,casp8、nrg1、itga3和vmp1均影响胶质瘤患者的预后,其中casp8与胶质瘤患者的os相关。
技术总结
本发明提供了一种长链非编码核糖核酸自噬影响神经胶质瘤的预后模型的构建方法,所属胶质瘤技术领域,通过筛选42个与胶质瘤自噬相关的lncrna基因,并将其与收集到的胶质瘤患者的临床os数据进行重叠,构建预后模型,获得了36个与预后相关的lncrna;并对36个预后相关基因进行了os分析。发现lncrna对os降低风险较高的胶质瘤患者的预后具有重要意义。通过roc分析验证了自噬相关lncrna胶质瘤预后模型可以指导胶质瘤患者的靶向治疗策略,降低死亡率和复发率,提高患者的生存期和预后。提高患者的生存期和预后。提高患者的生存期和预后。
技术研发人员:易黎 宋颖 焦慧丽
受保护的技术使用者:北京大学深圳医院(北京大学深圳临床医学院)
技术研发日:2023.08.29
技术公布日:2023/10/10